Усть-Илимская санэпидстанция организована в феврале 1969 года. Располагалась она на первом этаже деревянного жилого дома левобережной части города. Первоначально в штате были: один санитарный врач – Владимир Григорьевич Конев, два помощника санитарного врача – Тамара Николаевна Ладур, Валентина Васильевна Еманова, два помощника эпидемиолога – Галина Ивановна Моисеенко и Галина Михайловна Щербаченко.
Бактериологическая лаборатория начала свою работу в конце 1969 года. Её коллектив состоял из четырёх человек. Значительная доля работы санитарной службы приходилась на контроль за строительством и пуском в эксплуатацию ГЭС, ЛПК. Огромный вклад в эту работу внесли: Евгений Владимирович Бордовский, Владимир Валентинович Суворов, Валентина Петровна Лаптева. Антонина Буентуевна Матошкинова проработала заведующей бактериологической лабораторией с 1978 по 2005 год. Она первая в области идентифицировала местный штамм палочки псевдотуберкулёза.
Санитарно-гигиеническая лаборатория была организована в 1976 году. Бессменным руководителем является Верещагина Нина Семеновна. Стремительно строился и развивался молодой город: запускались скважины, открывались новые цеха заводов ЛПК, предприятия пищевой промышленности (молочный завод, мясокомбинат, хлебозавод), школы, детские сады. Возникла необходимость исследований на химические показатели воды, воздуха, питания в детских учреждениях. Коллектив лаборатории (врач и два лаборанта), начинал свою работу в 2-х комнатной секции деревянного жилого дома. Из оборудования имели весы, ФЭК и рефрактометр, немного посуды и необходимый набор реактивов.
В том же 1976 году был заложен фундамент нынешнего здания на окраине города. В новом здании для санитарно-гигиенической лаборатории было отведено крыло третьего этажа, с новым оборудованием, вытяжной системой.
В новое здание коллектив СЭС переехал в 1984 году. Но до этого на протяжении трёх лет работники два раза в неделю становились строителями, работая на новом здании.
С первых дней основания организации эпидемиологи проводили большую профилактическую работу, активно занимались организацией прививочного дела.
В 70-е годы, в период строительства города много внимания приходилось уделять организации противоэпидемических мероприятий, в связи с интенсивным распространением заболеваемости острой дизентерией, вирусным гепатитом «А». Периодически возникали вспышки, групповые заболевания в детских дошкольных учреждениях. Огромный вклад в локализацию и купирование этой заболеваемости внесли опытные эпидемиологи: Татьяна Семеновна Квитко, Виктор Генрихович Павлик, Лидия Николаевна Богославская, Мария Никитична Михалева, Наталья Юрьевна Стамболиди.
В 90-е годы на территории города и района была вспышечная заболеваемость дифтерией, появилась ВИЧ-инфекция, дали значительный рост парентеральные гепатиты. Помимо противоэпидемических мероприятий, проводилась широкая санитарно-просветительная работа среди населения.
Руководство санитарно-эпидемиологической службой на территории осуществляли: Владимир Григорьевич Конев (февраль 1969 – сентябрь 1971), Степан Григорьевич Ковальчук (сентябрь1971 – сентябрь 1998), Алексей Николаевич Пережогин (сентябрь 1998 – апрель 2005).
Все этапы становления, реорганизации санитарно-эпидемиологической службы в городе прошла помощник врача по коммунальной гигиене Тамара Николаевна Ладур.
В 2005 году произошла реорганизация санитарно-эпидемиологической службы. С апреля 2005 года руководит службой начальник Территориального Отделения Управления Роспотребнадзора по Иркутской области в г. Усть-Илимске и Усть-Илимском районе – Людмила Владимировна Буркова и главный врач филиала Федерального бюджетного учреждения здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в Иркутской области» в г. Усть-Илимске и Усть-Илимском районе – Нурия Инсафовна Уварова.
В последние годы проводится переориентация деятельности учреждений службы в осуществлении государственного санитарно-эпидемиологического надзора в соответствии с требованиями Федерального законодательства.
За последние 10 лет в городе Усть-Илимске и Усть-Илимском районе достигнуты значительные успехи в снижении инфекционной заболеваемости. Имеет место стабилизация санитарно-гигиенической обстановки на территории.